重构研究目录结构：将research-topics整合到research/specialized/civilizations

- 在research/specialized下创建civilizations目录
- 将research-topics下的文明研究内容移动到新位置
- 删除空的中文目录和research-topics目录
- 更新所有相关文档中的路径引用

专题研究-工作文档/主索引.md

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 ### 2.1 蒙古文明研究
 
 #### 2.1.1 腾格里与天帝的对应关系
-**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research-topics/mongolia/腾格里与天帝的对应关系.md
+**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research/specialized/civilizations/mongolia/腾格里与天帝的对应关系.md
 
 **主要内容**：
 - T音密码的音韵考古学分析
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 - 跨文化意义与当代价值
 
 #### 2.1.2 蒙古语与古代汉语的音韵联系
-**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research-topics/mongolia/蒙古语与古代汉语的音韵联系.md
+**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research/specialized/civilizations/mongolia/蒙古语与古代汉语的音韵联系.md
 
 **主要内容**：
 - 声母对应关系分析
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 ### 2.2 犹太文明研究
 
 #### 2.2.1 希伯来语与东方语言的音韵联系
-**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research-topics/judaism/希伯来语与东方语言的音韵联系.md
+**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research/specialized/civilizations/judaism/希伯来语与东方语言的音韵联系.md
 
 **主要内容**：
 - 辅音系统对应（K/M/T/S音）
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 ### 2.3 中华文明研究
 
 #### 2.3.1 中国古代音韵系统与核心概念
-**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research-topics/chinese-civilization/中国古代音韵系统与核心概念.md
+**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research/specialized/civilizations/chinese-civilization/中国古代音韵系统与核心概念.md
 
 **主要内容**：
 - 音韵考古学与六书的关系
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 ### 2.4 西方文明研究
 
 #### 2.4.1 希腊罗马文明与东方文明的音韵联系
-**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research-topics/western-civilization/希腊罗马文明与东方文明的音韵联系.md
+**文件路径**：/home/ben/code/huhan3000/research/specialized/civilizations/western-civilization/希腊罗马文明与东方文明的音韵联系.md
 
 **主要内容**：
 - 希腊字母与东方文字的音韵联系

专题研究-工作文档/文档整理方案.md

@@ -30,19 +30,19 @@ core-theory/
 
 ### 第二类：专题研究文档
 ```
-research-topics/
+research/specialized/civilizations/
-├── 蒙古文明研究/
+├── mongolia/
 │   ├── 博尔只斤音韵分析.md
 │   ├── 成吉思汗命名仪式.md
 │   └── 狼图腾文化解构.md
-├── 犹太文明研究/
+├── judaism/
 │   ├── 便雅悯支派分析.md
 │   └── 圣经音韵密码.md
-├── 中华文明研究/
+├── chinese-civilization/
 │   ├── 太极天命密码.md
 │   ├── 太太称呼源流.md
 │   └── 太字系列研究.md
-└── 西方文明研究/
+└── western-civilization/
     ├── Notre Dame分析.md
     └── 拉丁语系音韵.md
 ```
@@ -75,7 +75,7 @@ archive/
 
 ### 第一步：创建新的目录结构
 ```bash
-mkdir -p core-theory research-topics practical-applications archive
+mkdir -p core-theory research/specialized/civilizations practical-applications archive
 ```
 
 ### 第二步：核心理论文档整合

爹学整理中心/爹学整理中心优化方案.md

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 #### 3.1 从项目其他位置迁移内容
 - 从`core-theory/`目录迁移相关理论文档到`核心理论/`
-- 从`research-topics/`目录迁移相关研究内容到`专题研究/`
+- 从`research/specialized/civilizations/`目录迁移相关研究内容到`专题研究/`
 - 从`literary-works/`目录迁移相关文学批评内容到`应用实践/文学批评/`
 
 #### 3.2 内容去重与整合

项目结构说明.md

@@ -33,7 +33,7 @@ huhan3000是一个综合性研究项目，包含历史文化研究、理论分
 ### 学术论文与研究
 - **academic-papers/** - 学术论文组织，包含文化研究、符号信仰等
 - **historical-research/** - 历史研究，包含建筑、地理、伊斯兰中国等
-- **research-topics/** - 研究主题，包含中华文明、犹太文明、蒙古文明等
+- **research/specialized/civilizations/** - 文明研究主题，包含中华文明、犹太文明、蒙古文明等
 
 ### 理论体系
 - **research/core-theory/** - 核心理论研究，包含文明传播模型、爹学理论体系、音韵考古学基础等